Select All    Deselect All
 |   | 
Details
   print
  Records Links
Author Guillaume Schwob, Nicolás I. Segovia, Claudio González-Wevar, Léa Cabrol, Julieta Orlando, Elie Poulin doi  isbn
openurl 
  Title Exploring the Microdiversity Within Marine Bacterial Taxa: Toward an Integrated Biogeography in the Southern Ocean Type Journal
  Year 2021 Publication Frontiers in Microbiology Abbreviated Journal  
  Volume 12 Issue (up) Pages 1985  
  Keywords  
  Abstract Most of the microbial biogeographic patterns in the oceans have been depicted at the whole community level, leaving out finer taxonomic resolution (i.e., microdiversity) that is crucial to conduct intra-population phylogeographic study, as commonly done for macroorganisms. Here, we present a new approach to unravel the bacterial phylogeographic patterns combining community-wide survey by 16S rRNA gene metabarcoding and intra-species resolution through the oligotyping method, allowing robust estimations of genetic and phylogeographic indices, and migration parameters. As a proof-of-concept, we focused on the bacterial genus Spirochaeta across three distant biogeographic provinces of the Southern Ocean; maritime Antarctica, sub-Antarctic Islands, and Patagonia. Each targeted Spirochaeta operational taxonomic units were characterized by a substantial intrapopulation microdiversity, and significant genetic differentiation and phylogeographic structure among the three provinces. Gene flow estimations among Spirochaeta populations support the role of the Antarctic Polar Front as a biogeographic barrier to bacterial dispersal between Antarctic and sub-Antarctic provinces. Conversely, the Antarctic Circumpolar Current appears as the main driver of gene flow, connecting sub-Antarctic Islands with Patagonia and maritime Antarctica. Additionally, historical processes (drift and dispersal limitation) govern up to 86% of the spatial turnover among Spirochaeta populations. Overall, our approach bridges the gap between microbial and macrobial ecology by revealing strong congruency with macroorganisms distribution patterns at the populational level, shaped by the same oceanographic structures and ecological processes.  
  Programme 1044  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN 1664-302X ISBN 1664-302X Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 6457  
Permanent link to this record
 

 
Author Jérémy Tornos openurl 
  Title Approches intégrées en écologie de la conservation des oiseaux marins : cas de l’utilisation d'autovaccins pour la conservation des albatros sur l'île d'Amsterdam Type Thesis
  Year 2021 Publication Abbreviated Journal  
  Volume Issue (up) Pages  
  Keywords  
  Abstract L’Albatros à nez jaune de l’océan indien (Thalassarche carteri) est une espèce menacée d’extinction dont la population principale, qui se reproduit sur l’île Amsterdam (Terres Australes et Antarctiques Françaises), connait un déclin et une très forte mortalité des jeunes individus depuis plusieurs décennies. La bactérie responsable du choléra aviaire, Pasteurella multocida, est suspectée comme étant à l'origine de ces mortalités et notre équipe évalue depuis plusieurs années maintenant l'utilisation d'un vaccin pour protéger les poussins, via leur vaccination directe, mais aussi celle des femelles reproductrices susceptibles de transmettre des anticorps protecteurs à leur poussin. Le vaccin utilisé est un vaccin autologue (autovaccin) spécifiquement développé par Ceva-Biovac contre une souche de la bactérie Pasteurella multocida isolée sur cadavre d’albatros. Suite à l’obtention de premiers résultats prometteurs, les objectifs de la thèse étaient d’ajuster le protocole de vaccination, mais également de mieux appréhender et décrire les processus éco-épidémiologiques en jeu au sein des populations de vertébrés de l’île Amsterdam. Ceci a reposé sur l'analyse fine du suivi de couples reproducteurs année après année, mais aussi sur l'utilisation de données éco-épidémiologiques expérimentales complémentaires, notamment une nouvelle formulation du vaccin. Une diversité de pathogènes responsables de mortalités a pu être caractérisée. L’âge optimal de vaccination des poussins parait être vers 10 jours et la vaccination des femelles reproductrices semble pouvoir protéger les poussins pendant plusieurs années, mais la forte densité de rats (Rattus norvegicus) actifs dans les colonies a rendu difficile l’identification d’un effet protecteur fort du vaccin. Les résultats obtenus améliorent la compréhension des mécanismes de circulation d'agents infectieux chez des espèces à reproduction coloniale et permettront de comparer les bénéfices relatifs attendus de différents scénarios de vaccination. Le travail montre l’importance d’intégrer des approches complémentaires, notamment du domaine biomédical et de l’écologie des populations, pour aborder la problématique de l’émergence de maladies infectieuses dans le contexte des changements environnementaux actuels.  
  Programme 1151  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 6711  
Permanent link to this record
 

 
Author Dedieu, J.-P., A. Wendleder, B. Cerino, J. Boike, E. Bernard, J.-C. Gallet, and H.-W. Jacobi doi  openurl
  Title Snow change detection from polarimetric SAR time-series at X-band (Svalbard, Norway), EGU General Assembly 2021, online, 19–30 Apr 2021, EGU21-149. Type Peer-reviewed symposium
  Year 2021 Publication Egusphere Abbreviated Journal  
  Volume Issue (up) Pages  
  Keywords  
  Abstract

Due to recent climate change conditions, i.e. increasing temperatures and changing precipitation patterns, arctic snow cover dynamics exhibit strong changes in terms of extent and duration. Arctic amplification processes and impacts are well documented expected to strengthen in coming decades. In this context, innovative observation methods are helpful for a better comprehension of the spatial variability of snow properties relevant for climate research and hydrological applications.

Microwave remote sensing provides exceptional spatial and temporal performance in terms of all-weather application and target penetration. Time-series of Synthetic Active Radar images (SAR) are becoming more accessible at different frequencies and polarimetry has demonstrated a significant advantage for detecting changes in different media. Concerning arctic snow monitoring, SAR sensors can offer continuous time-series during the polar night and with cloud cover, providing a consequent advantage in regard of optical sensors.

The aim of this study is dedicated to the spatial/temporal variability of snow in the Ny-Ålesund area on the Br∅gger peninsula, Svalbard (N 78°55’ / E 11° 55’). The TerraSAR-X satellite (DLR, Germany) operated at X-band (3.1 cm, 9.6 GHz) with dual co-pol mode (HH/VV) at 5-m spatial resolution, and with high incidence angles (36° to 39°) poviding a better snow penetration and reducing topographic constraints. A dataset of 92 images (ascending and descending) is available since 2017, together with a high resolution DEM (NPI 5-m) and consistent in-situ measurements of meteorological data and snow profiles including glaciers sites.

Polarimetric processing is based on the Kennaugh matrix decomposition, copolar phase coherence (CCOH) and copolar phase difference (CPD). The Kennaugh matrix elements K0, K3, K4, and K7 are, respectively, the total intensity, phase ratio, intensity ratio, and shift between HH and VV phase center. Their interpretation allows analysing the structure of the snowpack linked to the near real time of in-situ measurements (snow profiles).

The X-band signal is strongly influenced by the snow stratigraphy: internal ice layers reduce or block the penetration of the signal into the snow pack. The best R2 correlation performances between estimated and measured snow heights are ranging from 0.50 to 0.70 for dry snow conditions. Therefore, the use of the X-band for regular snow height estimations remains limited under these conditions.

Conversely, this study shows the benefit of TerraSAR-X thanks to the Kennaugh matrix elements analysis. A focus is set on the Copolar Phase Difference (CPD, Leinss 2016) between VV and HH polarization: Φ CPD = Φ VV – Φ HH. Our results indicate that the CPD values are related to the snow metamorphism: positive values correspond to dry snow (horizontal structures), negative values indicate recrystallization processes (vertical structures).

Backscattering evolution in time offer a good proxy for meteorological events detection, impacting on snow metamorphism. Fresh snowfalls or melting processes can then be retrieved at the regional scale and linked to air temperature or precipitation measurements at local scale. Polarimetric SAR time series is therefore of interest to complement satellite-based precipitation measurements in the Arctic.

 
  Programme 1126  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN EGU21-149 ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 7247  
Permanent link to this record
 

 
Author Charlène Guillaumot file  openurl
  Title Modelling the response of Antarctic marine species to environmental changes. Methods, applications and limitations. /// Modéliser la réponse des espèces marines antarctiques aux changements environnementaux. Méthodes, applications et limites. Type Thesis
  Year 2021 Publication Thèse de doctorat. université libre de bruxelles / université de bourgogne franche-comté Abbreviated Journal  
  Volume Issue (up) Pages 620 pp.  
  Keywords  
  Abstract Parmi les outils qui permettent de mieux comprendre les systèmes naturels, la modélisation écologique a connu un essor particulièrement important depuis une vingtaine d’années. Les modèles écologiques, représentation simplifiée d’une réalité complexe, permettent de mettre en avant les facteurs environnementaux qui déterminent la niche écologique des espèces et de mieux comprendre leur réponse aux changements de l’environnement. Dans le cas des faunes marines antarctiques, la modélisation écologique fait face à plusieurs défis méthodologiques. Les jeux de données de présence des espèces sont très souvent agrégés dans le temps et dans l’espace, à proximité des stations de recherche. Ces données sont souvent trop peu nombreuses pour caractériser l’espace environnemental occupé par les espèces ainsi que leur physiologie. Enfin, les jeux de données environnementales manquent encore de précision pour finement représenter la complexité des habitats marins. Dans ces conditions, est-il possible de générer des modèles performants et justes à l’échelle de l’océan Austral ? Quelles sont les approches possibles et leurs limites ? Comment améliorer les méthodes afin de générer de meilleurs modèles ? Au cours de ce travail de thèse, trois types de modèles ont été étudiés et leurs performances évaluées. (1) Les modèles physiologiques de type DEB (Dynamic Energy Budget) simulent la manière dont l’environnement abiotique influe sur le métabolisme des individus et proposent une représentation de la niche fondamentale des espèces. (2) Les modèles de distribution d’espèces (SDMs pour Species Distribution Models) prédisent la probabilité de distribution des espèces en étudiant la relation spatiale entre données de présence et environnement. Ils proposent une représentation de la niche réalisée des espèces. Enfin (3), les modèles de dispersion de type lagrangien prédisent le mouvement de propagules dans les masses d’eau. Les résultats montrent que les modèles physiologiques réussissent à simuler les variations métaboliques des espèces antarctiques en fonction de l’environnement et à prédire les dynamiques de populations. Cependant, davantage de données sont nécessaires pour pouvoir caractériser finement les différences physiologiques entre populations et évaluer correctement les modèles. Les résultats obtenus pour les SDMs montrent que les modèles générés à l’échelle de l’océan Austral et leurs prédictions futures ne sont pas fiables du fait du manque de données disponibles pour caractériser l’espace occupé par les espèces, du manque de précision des scénarios climatiques futurs et de l’impossibilité d’évaluer les modèles. De plus, les modèles extrapolent sur une très grande proportion de l’espace projeté. L’apport d’information complémentaire sur les limites physiologiques des espèces (observations, résultats d’expériences, sorties de modèles physiologiques) permet de réduire l’extrapolation et d’augmenter la capacité des modèles à décrire la niche réalisée des espèces. L’agrégation spatiale des données, qui influençait les prédictions et l’évaluation des modèles a également pu être corrigée. Enfin, les modèles de dispersion ont montré un potentiel intéressant pour révéler le rôle des barrières géographiques ou à l’inverse, la connectivité spatiale, mais également le lien existant entre distribution, physiologie et histoire phylogénétique des espèces. Ce travail de thèse propose de nombreux conseils et fournit des codes annotés parfois sous forme de tutoriels, afin de constituer une aide utile aux futurs travaux de modélisation sur les espèces marines antarctiques.  
  Programme 688,1044  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis Bachelor's thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 6439  
Permanent link to this record
 

 
Author Nicolas Meyer, Loïc Bollache, Matthias Galipaud, Jérôme Moreau, François-Xavier Dechaume-Moncharmont, Eve Afonso, Anders Angerbjörn, Joël Bêty, Glen Brown, Dorothée Ehrich, Vladimir Gilg, Marie-Andrée Giroux, Jannik Hansen, Richard Lanctot, Johannes Lang, Christopher Latty, Nicolas Lecomte, Laura McKinnon, Lisa Kennedy, Jeroen Reneerkens, Sarah Saalfeld, Brigitte Sabard, Niels M. Schmidt, Benoît Sittler, Paul Smith, Aleksander Sokolov, Vasiliy Sokolov, Natalia Sokolova, Rob van Bemmelen, Øystein Varpe, Olivier Gilg doi  openurl
  Title Behavioural responses of breeding arctic sandpipers to ground-surface temperature and primary productivity Type Journal
  Year 2021 Publication Science of The Total Environment Abbreviated Journal  
  Volume 755 Issue (up) Pages 142485  
  Keywords Environmental conditions Incubation behaviour Incubation recesses Incubation strategy Lag effects NDVI Shorebird  
  Abstract Most birds incubate their eggs, which requires time and energy at the expense of other activities. Birds generally have two incubation strategies: biparental where both mates cooperate in incubating eggs, and uniparental where a single parent incubates. In harsh and unpredictable environments, incubation is challenging due to high energetic demands and variable resource availability. We studied the relationships between the incubation behaviour of sandpipers (genus Calidris) and two environmental variables: temperature and a proxy of primary productivity (i.e. NDVI). We investigated how these relationships vary between incubation strategies and across species among strategies. We also studied how the relationship between current temperature and incubation behaviour varies with previous day's temperature. We monitored the incubation behaviour of nine sandpiper species using thermologgers at 15 arctic sites between 2016 and 2019. We also used thermologgers to record the ground surface temperature at conspecific nest sites and extracted NDVI values from a remote sensing product. We found no relationship between either environmental variables and biparental incubation behaviour. Conversely, as ground-surface temperature increased, uniparental species decreased total duration of recesses (TDR) and mean duration of recesses (MDR), but increased number of recesses (NR). Moreover, small species showed stronger relationships with ground-surface temperature than large species. When all uniparental species were combined, an increase in NDVI was correlated with higher mean duration, total duration and number of recesses, but relationships varied widely across species. Finally, some uniparental species showed a lag effect with a higher nest attentiveness after a warm day while more recesses occurred after a cold day than was predicted based on current temperatures. We demonstrate the complex interplay between shorebird incubation strategies, incubation behaviour, and environmental conditions. Understanding how species respond to changes in their environment during incubation helps predict their future reproductive success.  
  Programme 1036  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN 0048-9697 ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 7553  
Permanent link to this record
 

 
Author Van Hanja J openurl 
  Title Caractérisation des habitats marins benthiques en zones côtières aux Iles Kerguelen par analyse d'images sous-marines Type Master 1
  Year 2021 Publication Master 1 Océanographie, Université de Liège Abbreviated Journal  
  Volume Issue (up) Pages 10 pp  
  Keywords  
  Abstract  
  Programme 1044  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 8062  
Permanent link to this record
 

 
Author Meudec L. openurl 
  Title Analyse de la diversité des astéries du Plateau des Kerguelen par approches génétique et morphologique et modélisation des habitats Type Master 2
  Year 2021 Publication Master 2 Sciences de la Mer, Sorbonne Universités Abbreviated Journal  
  Volume Issue (up) Pages 50 pp  
  Keywords  
  Abstract  
  Programme 1044  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 8063  
Permanent link to this record
 

 
Author Morgan Godard openurl 
  Title Caractérisation du comportement alimentaire de l'éléphant de mer Mirounga leonina et liens avec les structures physiques sub-mésoéchelles (1-10km) dans l'océan Austral : une approche par analyse de données fonctionnelles Type Thesis
  Year 2021 Publication Thèse de doctorat en Océanographie Abbreviated Journal  
  Volume Issue (up) Pages  
  Keywords  
  Abstract De nombreuses questions restent en suspens quant aux relations existantes entre les processus biologiques et physiques dans l'océan Austral. Pour répondre à ces questions, des enregistreurs électroniques sont déployés sur des prédateurs marins, et notamment sur des éléphants de mer austraux. Ces enregistreurs échantillonnent une grande variété de données physiques, biologies ou comportementales à haute fréquence générant ainsi une quantité considérable d’information. L’ensemble de ces données sont dites fonctionnelles car elles présentent un caractère commun : elles évoluent selon un continuum, qu’il soit spatial ou temporel. L’objectif de cette thèse est donc double, il s’agit d’étudier l’activité alimentaire de femelles éléphant de mer en relation avec les processus physiques de l’océan austral, tout en intégrant le caractère fonctionnel des données échantillonnées. Les résultats obtenus montrent que (1) par rapport aux méthodes classiquement employées, les méthodes d’analyse de données fonctionnelles permettent d’identifier une plus grande variété de comportements de plongées au sens biologique défini. (2) Ces approches fonctionnelles sont plus adaptées pour des données aux fréquences d’échantillonnage variable. (3) L’analyse de données fonctionnelles nous permet également d’accéder à la densité de nos individus, reflet de leur condition corporelle, et les comportements de plongées qu’ils adoptent ont une influence réelle sur cette condition corporelle, à différentes échelles de temps. (4) Il existe une relation entre les caractéristiques des masses d’eau rencontrées par les femelles éléphants de mer et les plongées qu’elles effectuent.  
  Programme 1201  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 7727  
Permanent link to this record
 

 
Author Karl-Ludwig Klein doi  openurl
  Title Radio Astronomical Tools for the Study of Solar Energetic Particles II.Time-Extended Acceleration at Subrelativistic and Relativistic Energies Type Journal
  Year 2021 Publication Frontiers in Astronomy and Space Sciences Abbreviated Journal  
  Volume 7 Issue (up) Pages 93  
  Keywords  
  Abstract Solar energetic particle (SEP) events are commonly separated in two categories: numerous “impulsive” events of relatively short duration, and a few “gradual” events, where SEP-intensities may stay enhanced over several days at energies up to several tens of MeV. In some gradual events the SEP spectrum extends to relativistic energies (>1 GeV), over shorter durations. The two categories are strongly related to an idea developed in the 1960s based on radio observations: Type III bursts, which were addressed in a companion chapter, outline impulsive acceleration of electrons to subrelativistic energies, while the large and the relativistic SEP events were ascribed to a second acceleration process. At radio wavelengths, typical counterparts were bursts emitted by electrons accelerated at coronal shock waves (type II bursts) and by electron populations in large-scale closed coronal structures (type IV bursts). Both burst types are related to coronal mass ejections (CMEs). Type II bursts from metric to kilometric wavelengths tend to accompany large SEP events, which is widely considered as a confirmation that CME-driven shocks accelerate the SEPs. But type II bursts, especially those related to SEP events, are most often accompanied by type IV bursts, where the electrons are rather accelerated in the wake of the CME. Individual event studies suggest that although the CME shock is the most plausible accelerator of SEPs up to some yet unknown limiting energy, the relativistic SEP events show time structure that rather points to coronal acceleration related to type IV bursts. This chapter addresses the question what type II bursts tell us about coronal shock waves and how type II and type IV radio bursts are related with relativistic proton signatures as seen by particle detectors on the Earth and by their gamma-ray emission in the solar atmosphere, focusing on two relativistic SEP events, on 2005 Jan 20 and 2017 Sep 10. The importance of radio emissions as a complement to the upcoming SEP observations from close to the Sun is underlined.  
  Programme 227  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN 2296-987X ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 7777  
Permanent link to this record
 

 
Author Juan Pedro Rodríguez-López, Brigitte Van Vliet-Lanoë, Jerónimo López-Martínez, Rebeca Martín-García doi  openurl
  Title Scouring by rafted ice and cryogenic patterned ground preserved in a Palaeoproterozoic equatorial proglacial lagoon succession, eastern India, Nuna supercontinent Type Journal
  Year 2021 Publication Marine and Petroleum Geology Abbreviated Journal  
  Volume 123 Issue (up) Pages 104766  
  Keywords Ice-rafted debris Iceberg scouring India Palaeoproterozoic Permafrost Proglacial Reticulate ice  
  Abstract The Chaibasa Formation contains the oldest known record of ploughmarks formed by rafted ice preserved on Earth. The Palaeoproterozoic (Orosirian-Rhyacian, 1.86–2.1 Ga) Chaibasa Formation in the Dhalbhumgarh area, eastern India, represents sedimentation in an ice-contact proglacial lagoon affected by iceberg (bits and growlers) calving and lake-ice rafting. Ice scouring, both on muddy and sandy substrates, as well as ice “rosettes” developed as consequence of the ploughing action of floating icebergs that were moved by wind, meltwater floods and tidal currents on soft sediments. Muddy flats surrounding the proglacial lagoon underwent seasonal deep freezing conditions developing cryogenic patterned ground containing reticulate ice, ice veins and sand wedges, suggesting the occurrence of proglacial permafrost areas coeval with Proterozoic glaciers. The central part of the proglacial lagoon was characterized by deposition of glacial varves punctuated by pebble and cobble size angular dropstones accumulated in the basin as ice-rafted debris from floating ice. Evidences provided in this paper reinforced the idea that 1.86–2.1 Ga ago glacial conditions prevailed after the supposed ending of the Huronian glaciation. This paper provides detailed examples that can be used to recognize possible floating/drifted ice scours in other Precambrian successions, as these elements have largely passed undetected, being probably widely reported in the literature as generic soft-sediment deformation structures. Similar soft-sediment deformations from Precambrian clastic depositional systems should be re-evaluated as there is a significant possibility that most of the Precambrian iceberg-related structures had escape notice, as originally suggested Eyles et al. in 1997.  
  Programme 316  
  Campaign  
  Address  
  Corporate Author Thesis  
  Publisher Place of Publication Editor  
  Language Summary Language Original Title  
  Series Editor Series Title Abbreviated Series Title  
  Series Volume Series Issue Edition  
  ISSN 0264-8172 ISBN Medium  
  Area Expedition Conference  
  Notes Approved yes  
  Call Number Serial 6471  
Permanent link to this record
Select All    Deselect All
 |   | 
Details
   print